Istituito con il motuproprio 29 dicembre 1847 sul Consiglio dei ministri. Attribuzioni: organizzazione, amministrazione, disciplina e mantenimento dell'armata pontificia. Dipendevano dal Ministero i corpi di linea, del genio e dell'artiglieria, l'armeria e le polveriere le fortezze militari compreso Castel Sant'Angelo, le scuole e istituti militari, le caserme gli ospedali militari, i lavori di difesa militare.